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[发明专利]一种分子式库的扩展方法-CN201910645529.1有效
发明人：金霞;杨红飞;韩瑞峰 -专利权人：杭州费尔斯通科技有限公司
申请日： 2019-07-17 - 公布日： 2020-06-02 - 主分类号： G16C20/90 文献下载
摘要：本发明公开了一种分子式库的扩展方法，对于自有分子库和新入分子库，自有分子库为已经持有的分子库，在自有分子库中保存了每个分子的完整分子式和指纹，新入分子库为新上传的分子库，由若干子库构成，由于把多个子库拼接成完整分子库的过程比较耗时，本发明对比自有分子库和新入分子库时只取其中必须拼接的分子式，过滤掉不必拼接就能得知其不重合的分子式，找出和自有分子库相同的分子式，将剩余不同的分子式加入自有分子库中，实现分子式库的快速扩展。
一种分子式扩展方法

[发明专利]小分子药物筛选通用分子库构建平台-CN202110314121.3在审
发明人：马松龄;马文志;赖力鹏;温书豪;马健 -专利权人：北京晶派科技有限公司
申请日： 2021-03-24 - 公布日： 2021-07-09 - 主分类号： G16B15/30 文献下载
摘要：一种小分子药物筛选通用分子库构建平台，包括分子生成模块：在化合物库的基础上进行预训练，通过靶点分子及活性预测模型对化学空间进行方向性探索和优化，根据活性分子的结构确定母核，切割侧链，对切割下来的侧链进行迁移学习生成侧链，将生成的侧链拼接到母核上生成具有生物活性的类药小分子，或基于整个参照分子的结构生成新的小分子结构，进行药物筛选，推荐到分子库；商业库及公共分子库模块：调用商业库或公共分子库，设置条件进行检索过滤，针对靶点、适应症类型进行筛选，进行药物筛选后，推荐到分子库；上述平台通过分子生成技术等，结合商业库及公共分子库，根据靶点信息构建小分子药物的定向分子库，更符合特定靶点配体结构的特点。
分子药物筛选通用构建平台

[发明专利]分子结构数据库构建方法、装置、电子设备及存储介质-CN202111584980.0在审
发明人：唐钰杰;苏飞;曾令江;周国剑;蒋伟 -专利权人：天翼云科技有限公司
申请日： 2021-12-22 - 公布日： 2022-05-10 - 主分类号： G16C20/90 文献下载
摘要：本发明揭示了一种分子结构数据库构建方法、装置、电子设备及存储介质，适用于化学领域。该方法包括：获取分子数据库；分子数据库与化学数据库关联；基于预设查询条件在分子数据库中查询目标分子，并确定目标分子的标识信息；根据标识信息，在化学数据库中查询目标分子的物性数据；根据物性数据，生成目标分子对应的可视化的采用该方法，不需要再从头基于分子的图论数据结构生成目标分子的3D结构因此，上述分子结构数据库构建方法，极大地减少了生成目标分子对应的可视化的3D结构的复杂性，且占用的系统的存储空间较少。
分子结构数据库构建方法装置电子设备存储介质

[发明专利]一种锆石捕收剂的量子化学和机器学习组合高通量筛选方法-CN202210596036.5在审
发明人：高志勇;何建勇;吴云霞;王秋浩;孙伟;张晨阳;葛玉波 -专利权人：中南大学
申请日： 2022-05-26 - 公布日： 2022-09-06 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本申请公开了一种锆石捕收剂的量子化学和机器学习组合高通量筛选方法，包括：建立浮选药剂的分子数据库R；对分子数据库R中的分子进行离子化，得到离子化分子数据库A；得到分子数据库RA；将锆石矿物金属位点羟基化形成锆石靶点分子数据库T，得到分子数据库RT；获得量子化学参数及log文件；提取分子结构性质参数；训练机器学习模型预测反应吉布斯自由能；筛选浮选药剂；获得靶向锆石浮选捕收剂。本申请通过数学模型能够快速预测分子数据库RA中的分子与不同离子之间的反应吉布斯自由能，从而快速高效实现药剂筛选，相比于传统药剂筛选方案，筛选效率高，准确率高。
一种锆石捕收剂量子化学机器学习组合通量筛选方法

[发明专利]基于三维子结构的药物分子比较方法-CN201710852115.7有效
发明人：徐峻;利秀明;严鑫 -专利权人：广州市爱菩新医药科技有限公司
申请日： 2017-09-20 - 公布日： 2020-05-05 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：本发明公开了一种基于三维子结构的药物分子比较方法，涉及药物分子的设计与筛选技术领域。所述方法包括如下步骤：读入库分子的二维或三维结构信息，得到库分子的子结构匹配原子序列；读入查询分子和库分子的三维结构信息，以及查询子结构的相关信息，分别计算查询分子、库分子各自子结构的自身重叠体积与各自边链的自身重叠体积；计算查询分子和库分子多种叠合情况下的重叠体积；分别计算查询分子和库分子子结构相似度。所述方法能提高分子形状比较的灵活性，更利于先导化合物的发现，可应用于药物分子的虚拟筛选。
基于三维结构药物分子比较方法

[实用新型]一种智能分子保鲜库-CN201822136671.7有效
发明人：逄锐 -专利权人：广州极速制冷设备有限公司
申请日： 2018-12-19 - 公布日： 2019-12-20 - 主分类号： A23B7/144 文献下载
摘要：一种智能分子保鲜库，直冷式蒸发器组安装在分子保鲜库体内除门体一侧的另外三侧；冷凝器机组的输出与所述的直冷式蒸发器组连接；用于保鲜过程中循环供应或减压、分子储藏组件安装在分子保鲜库体的外部顶面且与分子保鲜库体之间通过管路连接；用于检测分子保鲜库体内的温度、湿度及保鲜气分子含量的检测单元安装在分子保鲜库体内，将检测的信息发送至人工智能系统；人工智能系统根据接收的外部输入的控制参数或者利用预先存储的控制参数结合检测单元检测的参数，控制冷凝器机组、直冷式蒸发器组通过直冷的方式使分子保鲜库体中的温度达到要求的保鲜温度；控制环境参数调控组件使得分子保鲜库体中的湿度及保鲜气分子含量满足保鲜要求。
保鲜库体保鲜库直冷式蒸发器人工智能系统冷凝器机组控制参数体内检测保鲜过程保鲜要求参数调控单元安装单元检测管路连接结合检测控制环境信息发送预先存储组件安装减压组连接外部顶面门体直冷保鲜输出智能

[发明专利]基于数据库的三维结构检索方法、电子设备及存储介质-CN201811574370.0在审
发明人：严鑫;张德康;林永胜;刘志红 -专利权人：广州市爱菩新医药科技有限公司
申请日： 2018-12-21 - 公布日： 2019-05-03 - 主分类号： G16C20/40 文献下载
摘要：本发明公开了基于数据库的三维结构检索方法，包括如下步骤：获取库分子的三维形状特征信息，根据三维形状特征信息建立基于C语言的库分子高斯表达；根据数据库的预设扩展格式将C语言的高斯表达处理为相应的多种检索扩展表达，形成检索扩展表达集；读入待检索分子的三维形状特征信息，生成相应的待检索分子高斯表达；将待检索分子高斯表达与检索扩展表达集进行匹配，以选取数据库中与待检索分子的高斯表达匹配度最高的库分子。本发明通过构建分子三维结构的高斯表达以及检索扩展表达集，对待检索分子进行子结构和边链进行匹配比较，从而可以筛选出相似度最高的三维结构。
检索高斯三维结构三维形状特征信息数据库存储介质电子设备扩展格式匹配比较匹配度相似度子结构边链读入构建预设匹配筛选

[发明专利]小分子激酶抑制剂筛选分子库构建方法及系统-CN202110315008.7有效
发明人：马松龄;马文志;赖力鹏;温书豪;马健 -专利权人：北京晶泰科技有限公司
申请日： 2021-03-24 - 公布日： 2023-06-23 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：一种小分子激酶抑制剂筛选分子库构建方法及系统包括：将分子与单环或双环的骨架进行匹配，匹配后将对应部分作为母核，切开与该母核相连的碳‑杂原子非环单键，对切割后片段进行分拣，分为母核与侧链，根据设定条件筛选侧链，将符合条件的侧链加入侧链库；根据参照分子侧链设置过滤条件进行过滤，从侧链库中取出符合条件的侧链，进行分子生成，将生成侧链拼接到参照分子母核上，建立待筛分子库；上述小分子激酶抑制剂筛选分子库构建方法及系统通过侧链与母核的拆分、分拣、生成、拼接为小分子激酶抑制剂的筛选提供优质的分子来源，通过分子生成对侧链或母核进行扩增，设置过滤条件进行过滤，得到多样性更强的针对特定靶点的定向分子库。
分子激酶抑制剂筛选构建方法系统

[发明专利]一种分子动力学仿真测试系统-CN202011155391.6在审
发明人：包建东;钟岗;王财勇 -专利权人：安徽众新电子科技有限公司
申请日： 2020-10-26 - 公布日： 2021-01-05 - 主分类号： G16C10/00 文献下载
摘要：本发明公开了一种分子动力学仿真测试系统，具体涉及分子动力学技术领域，包括建立模块，用于建立分子动力学数据库和分子动力学仿真软件；所述分子动力学数据库储存于服务器中，且包含有各种分子动力学研究模型；预处理模块，对所述分子动力学数据库进行预设的连接处理，以实现所述分子动力学数据库与所述分子动力学仿真软件Materials Studio的通信连接；仿真测试模块，用于基于所述分子动力学仿真软件MaterialsStudio、所述分子动力学数据库，对所述分子动力学研究模型进行软硬件协同仿真测试。
一种分子动力学仿真测试系统

[发明专利]一种分子片段库的确定方法、分子分割方法及装置-CN202110519595.1在审
发明人：李相彬;邹德超 -专利权人：北京望石智慧科技有限公司
申请日： 2021-05-12 - 公布日： 2021-08-06 - 主分类号： G16C20/20 文献下载
摘要：本发明公开了一种分子片段库的确定方法、分子分割方法及装置，其中，分子片段库的确定方法包括：获取分子数据集；对所述分子数据集中的分子进行切割，得到多种分子片段以及每一种分子片段的初始分割概率；根据预设算法更新所述每一种分子片段的初始分割概率，得到所述分子片段的目标分割概率；将所述目标分割概率满足预设条件的分子片段的集合确定为分子片段库。本发明通过对分子数据集中的分子进行分割，得到多种分子片段以及对应的初始分割概率，利用预设算法更新初始分割概率，使得得到的分子片段的概率更加准确，便于利用该分子片段库对分子进行分割。
一种分子片段确定方法分割装置

[发明专利]迭代式结合亲和力评估模型的构建方法和系统-CN202111388260.7有效
发明人：孙伟杰 -专利权人：北京深势科技有限公司
申请日： 2021-11-22 - 公布日： 2023-03-31 - 主分类号： G16C20/50 文献下载
摘要：该方法包括：步骤A：对大规模分子库进行数据聚类后抽样，得到特征分子库；步骤B：确定所述特征分子库在目标药用靶点上的结合亲和力指标；步骤C：以所述特征分子库为输入，所述结合亲和力指标为输出，使用机器学习工具训练以得到若干个预测模型；步骤D：对所述大规模分子库中的每一个数据点进行如下操作：使用所述若干个预测模型进行结合亲和力预测得到若干个预测结果，根据所述若干个预测结果的统计信息计算重要性指标，根据所述重要性指标确定候选分子库；步骤E：将所述候选分子库替换步骤B中的特征分子库，重复步骤B至步骤D，直至满足预设迭代终止条件，输出优化模型。
迭代式结合亲和力评估模型构建方法系统

[发明专利]一种用于筛选抗癌活性小分子的组合化学分子数据库CCSMD及应用-CN202210559100.2在审
发明人：陈朋;张豪 -专利权人：兰州大学
申请日： 2022-05-22 - 公布日： 2022-07-22 - 主分类号： G16C20/64 文献下载
摘要：本发明属于医药领域，具体涉及一种通过智能组合的方法建库，并且利用该库发现抗癌活性小分子。本发明建立了一个存在12904个分子的虚拟数据库，该数据库的虚拟分子是通过现实存在且可购买的分子砌块利用Python进行组合，智能组合的条件是成熟且简易的反应条件，因此该数据库的小分子拥有易合成的特点，利用该数据库进行虚拟筛选，对于筛选出的分子进行合成可以获得具有高活性的抗癌活性小分子，该分子正常胃黏膜细胞的基本无毒；具有显著的治疗胃癌的效果，并且治疗胃癌的效果优于顺铂，因此具有良好的应用前景。
一种用于筛选抗癌活性分子组合化学数据库 ccsmd 应用

[发明专利]一种美丽库蠓特异基因及其分子鉴定方法-CN201610011293.2有效
发明人：陈敏;黄恩炯;蔡怡珊;高博;张建庆;王飞鹏 -专利权人：福建国际旅行卫生保健中心
申请日： 2016-01-08 - 公布日： 2019-04-05 - 主分类号： C12N15/53 文献下载
摘要：本发明公开一种美丽库蠓特异基因及其分子鉴定方法，其特征在于采用分子生物学方法获取该库蠓的COⅠ基因序列，通过基因序列相似性的比对，对该库蠓进行种类鉴定。本发明提供的美丽库蠓分子鉴定方法，有利于实现美丽库蠓准确、快速的鉴定。
一种美丽特异基因及其分子鉴定方法

[发明专利]推断环境系统中有机质分子转化的方法-CN202310832162.0在审
发明人：邓晔;杨兴盛;王尚;冯凯 -专利权人：中国科学院生态环境研究中心
申请日： 2023-07-06 - 公布日： 2023-10-27 - 主分类号： G16C20/30 文献下载
摘要：本申请提供一种推断环境系统中有机质分子转化的方法，包括：获取同一环境系统的多个样品；确定每个样品中有机质的分子式和相对丰度；根据所有样品确定的分子式构建分子式库；计算分子式库中每个分子对的分子差异；根据所有分子差异构建第一分子差异库；根据相对丰度计算每个分子差异对应的分子对的关联性系数；将关联性系数大于或等于第一预设值的分子对对应的分子差异组成第二分子差异库；计算第二分子差异库中每种分子差异的第二占比大于第一占比的显著性系数；筛选显著性系数小于第二预设值的分子差异作为该环境系统的分子转化本申请提供的推断环境系统中有机质分子转化的方法，简单方便，可以快速有效推断发生的分子转化，可靠性强。
推断环境系统有机质分子转化方法

[发明专利]一种库蠓近缘种的DNA条形码标准序列及其分子鉴定方法-CN201810084450.1有效
发明人：侯晓晖;岑常活;段琛 -专利权人：遵义医学院
申请日： 2018-01-29 - 公布日： 2020-05-05 - 主分类号： C12Q1/6888 文献下载
摘要：本发明公开一种库蠓近缘种的DNA条形码标准序列及其分子鉴定方法，其特征在于采用分子生物学DNA测序的方法获取长喙库蠓、新竹库蠓和白带库蠓等库蠓近缘种的COⅠ基因序列，再通过基因序列相似性比对，从而根据比对结果对该库蠓近缘种进行种类鉴定本发明提供的长喙库蠓、新竹库蠓和白带库蠓等库蠓近缘种的分子鉴定方法，有利于实现上述三种库蠓的快速、准确的鉴定。
一种近缘 dna 条形码标准序列及其分子鉴定方法

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